巨噬細胞Macrophages是除粒細胞（嗜中性粒細胞、嗜酸性粒細胞和嗜堿性粒細胞）和樹突狀細胞（DC）之外的三種吞噬細胞類型之一。微生物一旦進入宿主，機體的第一道免疫防線就打開，這些吞噬細胞中的一種或者多種就會將其識別并吞噬破壞，這一過程稱為吞噬作用。大多數病原體通過呼吸系統、腸粘膜、皮膚損傷或泌尿生殖道進入宿主。由于巨噬細胞聚集在粘膜下層組織中，它們通常是第一個遇到病原體的防御細胞。當某些吞噬細胞受體（通常是病原體*的碳水化合物或脂質結構）與病原體表面相互作用時，吞噬作用就開始了。

在第一次相互作用后，吞噬細胞質膜將病原體包圍并內化在一個被稱為吞噬體的大膜包裹的內吞囊泡中。然后吞噬體與一個或多個溶酶體融合，形成吞噬溶酶體，溶酶體是含有抗菌肽和酶的小囊泡。溶酶體內容物被釋放到吞噬溶酶體中，吞噬溶酶體反過來經歷酸化和酶促過程，生成高活性的一氧化氮和超氧化物自由基來殺死病原體。

關于噬細胞受體的兩個例子是Dectin-1和甘露糖受體(CD206)。兩者都是C型凝集素樣家族的成員。Dectin-1由巨噬細胞和中性粒細胞表達，并與真菌細胞壁中常見的葡萄糖聚合物結合。CD206由巨噬細胞和DC表達，并與真菌、細菌和病毒共有的多種甘露糖基化配體結合。